在网络架构上，BioMD 直接在全原子笛卡尔坐标上工作，由 SE (3) 等变图 Transformer 编码初始构象的空间几何约束，再由 FlowTrajectoryTransformer 在整条轨迹上同时建模帧内原子交互（AttentionPairBias）与跨帧时序依赖（TemporalAttention）。

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四十年来，在四川考古工作者的持续努力下，成都平原先秦时期的文化发展序列得以厘清：距今5000年左右的桂圆桥文化，见证了来自西北地区马家窑文化人群携彩陶与旱作农业技术南下，与本地传统融合的过程；来到宝墩文化阶段，长江中游稻作技术的传入进一步加速了社会复杂化，为三星堆与金沙的辉煌奠定了坚实的本土基础。